Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Phf6Q9D4J7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Phf6Q9D4J7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Phf6Q9D4J7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Phf6Q9D4J7 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Phf6Q9D4J7 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Phf6Q9D4J7 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Phf6Q9D4J7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Phf6Q9D4J7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms