Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pramef12Q9D2F1 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pramef12Q9D2F1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pramef12Q9D2F1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pramef12Q9D2F1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pramef12Q9D2F1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pramef12Q9D2F1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pramef12Q9D2F1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pramef12Q9D2F1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pramef12Q9D2F1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pramef12Q9D2F1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Pramef12Q9D2F1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms