Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snapc3Q9D2C9 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms