Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
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