Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp16Q99LG0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp16Q99LG0 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp16Q99LG0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp16Q99LG0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp16Q99LG0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp16Q99LG0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp16Q99LG0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp16Q99LG0 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp16Q99LG0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp16Q99LG0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp16Q99LG0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp16Q99LG0 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp16Q99LG0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp16Q99LG0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp16Q99LG0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp16Q99LG0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp16Q99LG0 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp16Q99LG0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms