Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Dok4Q99KE3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Dok4Q99KE3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Dok4Q99KE3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Dok4Q99KE3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Dok4Q99KE3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Dok4Q99KE3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Dok4Q99KE3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dok4Q99KE3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms