Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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