Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec3Q99J72 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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