Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ctu1Q99J10 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ctu1Q99J10 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ctu1Q99J10 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ctu1Q99J10 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ctu1Q99J10 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ctu1Q99J10 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ctu1Q99J10 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ctu1Q99J10 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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