Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfdQ925I7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfdQ925I7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfdQ925I7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfdQ925I7 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfdQ925I7 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfdQ925I7 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms