Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
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