Protein–RNA interactions for Protein: Q922U2

Krt5, Keratin, type II cytoskeletal 5, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt5Q922U2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt5Q922U2 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms