Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cabp4Q8VHC5 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms