Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms