Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Vmn1r200Q8R281 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Vmn1r200Q8R281 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Vmn1r200Q8R281 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Vmn1r200Q8R281 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Vmn1r200Q8R281 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vmn1r200Q8R281 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vmn1r200Q8R281 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms