Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Hoxc12Q8K5B8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Hoxc12Q8K5B8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Hoxc12Q8K5B8 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Hoxc12Q8K5B8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
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