Protein–RNA interactions for Protein: Q8K406

Lgi3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, mousemouse

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi3Q8K406 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Lgi3Q8K406 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Lgi3Q8K406 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Lgi3Q8K406 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Lgi3Q8K406 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Lgi3Q8K406 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Lgi3Q8K406 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lgi3Q8K406 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms