Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Lrrtm1Q8K377 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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