Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms