Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHY7

Ttc23, Tetratricopeptide repeat protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc23Q8CHY7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc23Q8CHY7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc23Q8CHY7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc23Q8CHY7 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc23Q8CHY7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc23Q8CHY7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ttc23Q8CHY7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ttc23Q8CHY7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc23Q8CHY7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ttc23Q8CHY7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ttc23Q8CHY7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc23Q8CHY7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc23Q8CHY7 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ttc23Q8CHY7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc23Q8CHY7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc23Q8CHY7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc23Q8CHY7 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc23Q8CHY7 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc23Q8CHY7 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ttc23Q8CHY7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Ttc23Q8CHY7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Ttc23Q8CHY7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ttc23Q8CHY7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc23Q8CHY7 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc23Q8CHY7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ttc23Q8CHY7 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ttc23Q8CHY7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ttc23Q8CHY7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc23Q8CHY7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ttc23Q8CHY7 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc23Q8CHY7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc23Q8CHY7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc23Q8CHY7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc23Q8CHY7 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc23Q8CHY7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc23Q8CHY7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc23Q8CHY7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc23Q8CHY7 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ttc23Q8CHY7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc23Q8CHY7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc23Q8CHY7 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ttc23Q8CHY7 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms