Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms