Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms