Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q8C5C9 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q8C5C9 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 242.9 ms