Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms