Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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FarsaQ8C0C7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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FarsaQ8C0C7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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FarsaQ8C0C7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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FarsaQ8C0C7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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FarsaQ8C0C7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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FarsaQ8C0C7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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FarsaQ8C0C7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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