Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Phf11d-202ENSMUST00000160425 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps41-201ENSMUST00000173587 980 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps7-201ENSMUST00000176244 1098 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm42952-203ENSMUST00000197784 798 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC192334.3-201ENSMUST00000221828 569 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Hsd11b1-205ENSMUST00000161737 1355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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