Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ctdsp2Q8BX07 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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