Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops7bQ8BV13 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7bQ8BV13 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms