Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D130040H23RikQ8BII3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms