Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms