Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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H2-M10.4Q85ZW8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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H2-M10.4Q85ZW8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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