Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms