Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms