Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms