Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms