Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Trappc6aQ78XR0 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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