Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms