Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trak1Q6PD31 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trak1Q6PD31 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trak1Q6PD31 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trak1Q6PD31 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trak1Q6PD31 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trak1Q6PD31 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trak1Q6PD31 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trak1Q6PD31 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trak1Q6PD31 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trak1Q6PD31 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trak1Q6PD31 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trak1Q6PD31 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trak1Q6PD31 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trak1Q6PD31 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trak1Q6PD31 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trak1Q6PD31 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trak1Q6PD31 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trak1Q6PD31 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trak1Q6PD31 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms