Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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