Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap20Q6IFT4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms