Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms