Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms