Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PtprdQ64487 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PtprdQ64487 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PtprdQ64487 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PtprdQ64487 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PtprdQ64487 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PtprdQ64487 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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PtprdQ64487 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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PtprdQ64487 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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PtprdQ64487 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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PtprdQ64487 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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