Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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PatjQ63ZW7 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PatjQ63ZW7 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PatjQ63ZW7 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PatjQ63ZW7 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PatjQ63ZW7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PatjQ63ZW7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PatjQ63ZW7 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PatjQ63ZW7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PatjQ63ZW7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PatjQ63ZW7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PatjQ63ZW7 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PatjQ63ZW7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PatjQ63ZW7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PatjQ63ZW7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PatjQ63ZW7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PatjQ63ZW7 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PatjQ63ZW7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PatjQ63ZW7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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