Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trim28Q62318 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trim28Q62318 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim28Q62318 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trim28Q62318 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trim28Q62318 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trim28Q62318 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms