Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall3Q62255 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms