Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
AcanQ61282 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
AcanQ61282 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms