Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Cln3Q61124 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.5 ms