Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms