Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms